Le Conseil des EPF formule la stratégie pour une période de prestations donnée dans son Plan stratégique pour le Domaine des EPF. Ce document est donc le principal instrument qui lui permet de fixer les orientations majeures dans l’enseignement, la recherche et le transfert de savoir, ainsi qu'en ce qui concerne les objectifs de politique scientifique, et de définir les grands projets prioritaires pour l’ensemble du Domaine des EPF. Ainsi, le Plan stratégique fournit aussi des indications sur les ressources nécessaires, tient lieu de fil rouge aux institutions du Domaine des EPF dans le cadre de leurs activités et leur sert de point de repère lors de l'élaboration de leurs plans de développement.